Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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