Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZFHX3Q15911 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms