Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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