Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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