Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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SS18Q15532 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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SS18Q15532 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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SS18Q15532 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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