Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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