Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD1Q15327 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms