Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms