Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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