Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMC2Q13753 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms