Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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