Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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