Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TOP3AQ13472 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOP3AQ13472 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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