Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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SKP2Q13309 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SKP2Q13309 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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