Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CLN3Q13286 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CLN3Q13286 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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