Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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IFT88Q13099 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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IFT88Q13099 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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IFT88Q13099 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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IFT88Q13099 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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IFT88Q13099 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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IFT88Q13099 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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IFT88Q13099 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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