Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXO1Q12778 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXO1Q12778 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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