Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYCNQ0VAF6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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