Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms