Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABPAQ06546 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms