Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PSME1Q06323 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms