Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms