Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NHLH2Q02577 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms