Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms