Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms