Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX1P83916 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX1P83916 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX1P83916 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX1P83916 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX1P83916 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX1P83916 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX1P83916 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX1P83916 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX1P83916 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX1P83916 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX1P83916 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX1P83916 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX1P83916 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms