Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms