Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB15P59190 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB15P59190 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB15P59190 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB15P59190 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB15P59190 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB15P59190 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB15P59190 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB15P59190 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB15P59190 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB15P59190 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB15P59190 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB15P59190 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB15P59190 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB15P59190 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms