Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC12A2P55011 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC12A2P55011 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC12A2P55011 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A2P55011 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A2P55011 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A2P55011 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A2P55011 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A2P55011 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A2P55011 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A2P55011 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A2P55011 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A2P55011 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A2P55011 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A2P55011 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A2P55011 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC12A2P55011 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms