Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms