Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NESP48681 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NESP48681 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NESP48681 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NESP48681 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NESP48681 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms