Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBRP36941 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms