Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms