Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms