Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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