Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms