Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms