Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTX3P26022 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTX3P26022 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTX3P26022 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTX3P26022 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTX3P26022 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTX3P26022 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTX3P26022 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTX3P26022 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTX3P26022 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms