Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRCP23327 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HRCP23327 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HRCP23327 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HRCP23327 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HRCP23327 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HRCP23327 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HRCP23327 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HRCP23327 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms