Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL4P13236 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL4P13236 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL4P13236 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL4P13236 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL4P13236 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL4P13236 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL4P13236 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL4P13236 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL4P13236 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL4P13236 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL4P13236 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL4P13236 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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