Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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