Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms