Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR89BP0CG08 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms