Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms