Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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