Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ESR1P03372 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ESR1P03372 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESR1P03372 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESR1P03372 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESR1P03372 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESR1P03372 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESR1P03372 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ESR1P03372 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms