Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPBO95292 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPBO95292 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPBO95292 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPBO95292 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPBO95292 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPBO95292 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPBO95292 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPBO95292 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPBO95292 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms