Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UPP2O95045 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UPP2O95045 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UPP2O95045 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP2O95045 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms