Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms