Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARPC5O15511 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms